RNA-seq 项目启动前的信息清单

分组信息需要可追溯

样本名称、实验组、对照组、批次和关键协变量应放在结构化表格中。不要只依赖文件名或聊天记录解释样本关系。

如果存在重复测量、配对设计或多个处理因素，应在统计建模前明确标注。

把科学问题转成比较关系

“看看有什么变化”通常不足以确定分析方案。更有效的方式是列出需要回答的比较，例如处理组相对对照组、不同时间点的变化趋势，或特定表型相关的表达模式。

提前约定交付范围

分析开始前应确认基础质控、差异分析、通路分析、图表、结果表格和方法说明是否在交付范围内，以及是否需要后续讨论或图表调整。